Synapsi järjestää vuosittain vähintään yhden ekskursion. Ekskursioita järjestetään sekä ulkomaalaisiin että suomalaisiin (yliopisto)kaupunkeihin. Synapsilaiset ovat käyneet muun muassa Skopjessa (2019), Budapestissä (2018) ja Irlannissakin (2016). Myös hieman tutummat kaupungit kuten Helsinki ja Tampere ovat olleet kohteina. Ekskursiokohteita kartoitetaan vuosittain jäsenistöltä ekskursion (tai ekskursioiden) suunniteluvaiheessa ja toiveita kohteista, matkustustavoista ja kustannuksista kuunnellaan.

Lisäksi Synapsi järjestää vuosittain retkiä lähialueiden luontokohteisiin. Kohteet pyritään aina valitsemaan siten, että sinne on pääsy esimerkiksi linja-autolla tai muilla julkisilla. Retket vaihtelevat aina päiväretkistä useamman yön eräretkiin.

Ekskursioiden järjestämisestä vastaa ekskursiovastaava(t) ja retkien järjestämisestä retkivastaava(t).